Hij is getrouwd met Maria Anna Sophia van Boineburg-Lengsfeld.
Zij zijn getrouwd op 13 maart 1668 te St. Laurens, Keulen, Nordrhein-Westfalen, hij was toen 23 jaar oud.
Kind(eren):
Bron: http://genealogics.org/getperson.php?personID=I00025161&tree=LEO
en: http://books.google.nl/books?id=vSVTvOZN410C&pg=PA289&lpg=PA289&dq=Graf+Melchior+Friedrich+von+Sch%C3%B6nborn&source=bl&ots=HuKN-plBqa&sig=WijBvlVeWm7TdaOeSh_XkVHWkwo&hl=nl&ei=TDlKSuSJEcns-Qb48rTfBQ&sa=X&oi=book_result&ct=result&resnum=9
De getoonde gegevens hebben geen bronnen.