Hij is getrouwd met Catharina Hartzma.
Toestemming voor het huwelijk is 16 november 1800 verkregen te Appingedam.Bron 3
Zij zijn getrouwd op 7 december 1800 te Zuidhorn, hij was toen 31 jaar oud.Bron 4In Zuidhorn staat de registratie van het voorgenomen huwelijk tussen Jannes Hindriks Steenhuis, van Appingedam en Katharina Hartzma, van Zuidhorn vermeld op 11 november 1800 en in Appigedam op 16 november 1800. Het huwelijk wordt voltrokken in Zuidhorn op 7 december 1800. Jannes is de zoon van Hindrik Pieters Steenhuis en Anje Pieters Toxopeus.
Uit het huwelijk van Jannes en Katharina zijn twee kinderen geboren:
1.Anje Steenhuis, geboren op 22 december 1801 en gedoopt op 28 december 1801 in Zuidhorn. Anje trouwt op 21 augustus 1824 in Zuidhorn met Fokke Fokkes van der Span, boereknecht. Zij overlijdt op 7 november 1875 in Noordhorn.
2.Hindrik Steenhuis, geboren 21 juni 1804 en gedoopt 8 juli 1804 in Zuidhorn. Hij is overleden op 12 juli 1812 in Zuidhorn.