Hij is getrouwd met Aleijdis Joannes Thomen van der Ameijden.
Ze zijn in de kerk getrouwd op 14 november 1593 te Oirschot, Noord-Brabant, Nederland.Bron 1
Kind(eren):
In 1601 vertegenwoordigt Marten Aelbrecht Penninx zijn zwager Adriaan Jan Thomas van der Ameijden, die Andries, zoon van Andries Andries van Ginhoven heeft doodgeslagen, bij het zoenaccoord (Campinia 17 - 153). De kinderen van Marten Aelbrecht Penninx gaan in april 1650 een erfdeling aan (Oirschot R173 folio 224).