Hij is getrouwd met Amelberga Theresia (Magdalena Theresia) De Winter.
Brouwer Jacobus van Landeghem († 30/07/1787), tweede echtgenote van Amelberga Theresia de Winter (1728–1803), was bij zijn overlijden nog 100 gulden schuldig aan Jan Baptiste Nijs voor een obligatie van gelijke waarde[1]. Zijn erfgenamen dienden ook nog eens een gulden voor het restat van dezelfde rente verschenen op 7 september 1787 te betalen, alsook zes gulden 2 stuivers ½ voor een bezette rente op een huis en erf genaamd de Bonte Koey verschenen op 18 februari 1787. Joannes Baptiste Nijs was overigens peter van hun dochter Maria Francisca van Landeghem (1770–1791) en de moeder van Amelberga Theresia de Winter, Anna Vertenten, was de schoonzuster van Joannes Baptiste Nijs
Zij zijn getrouwd op 28 december 1765 te Temse, België, hij was toen 23 jaar oud.
Kind(eren):
De getoonde gegevens hebben geen bronnen.