Hij is getrouwd met Hendrika Flierman.Bron 2
Zij zijn getrouwd op 9 februari 1844 te Epe , hij was toen 40 jaar oud.
(NOTE: huwelijk: RFN 139 CHAN DATE 15 JUL 1994), en hun kinderen: Antonia Koekkoek 1845-1889, Mechtilda Koekkoek 1846, Lammerdina Koekkoek 1848-1863, NN Koekkoek 1849-1849, Johannes Koekkoek 1850-1862, NN Koekkoek 1852-1852, Gerhardina Johanna Koekkoek 1853-1884, Alberta Petronella Koekkoek 1856-1925, Martina Koekkoek 1859-1868.